RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AQP4	P55087	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PPP3R1	P63098	170 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KISS1	Q15726	138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF737	O75373	536 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KDM4B	O94953	1096 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	EDDM3B	P56851	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF146	Q15072	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SNX22	Q96L94	193 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GPER1	Q99527	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LALBA	P00709	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GABRR1	P24046	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	WNT4	P56705	351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q6YL49	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GHSR	Q92847	366 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A0U1RQK1	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SH2D1B	O14796	132 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NPFF	O15130	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FBP1	P09467	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CALCB	P10092	127 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HSPA13	P48723	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BMX	P51813	675 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UBE2E1	P51965	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZP1	P60852	638 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KLRD1	Q13241	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GRK1	Q15835	563 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PAH	P00439	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MELTF	P08582	738 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DUSP1	P28562	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DLX1	P56177	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF273	Q14593	569 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885		Q499Y3	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms