RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZMYND11Q15326 602 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SSX1Q16384 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPEL1Q2QD12 228 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLLU1OSQ5K130 101 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C10orf91Q5T1B1 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CENPPQ6IPU0 288 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 NIPAL1Q6NVV3 410 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 COA5Q86WW8 74 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GID4Q8IVV7 300 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DAW1Q8N136 415 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM58AQ8N1B3 248 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 BBS5Q8N3I7 341 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYB561A3Q8NBI2 242 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR4K2Q8NGD2 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPACA4Q8TDM5 124 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAL2Q969L2 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 C8orf44Q96CB5 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDIT4LQ96D03 193 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RCN3Q96D15 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SCGB3A2Q96PL1 93 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2A7Q96R45 310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SRRQ9GZT4 340 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR51B5Q9H339 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ASB7Q9H672 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 XKR8Q9H6D3 395 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 REEP1Q9H902 201 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 VPS37BQ9H9H4 285 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAS2R9Q9NYW1 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DOK5Q9P104 306 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRO0628Q9UI54 55 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LINC00588Q9Y4M8 146 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR51B2Q9Y5P1 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 KDM5BQ9UGL1 1544 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DISP1Q96F81 1524 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A075B6Q4 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A1W2PRG6 482 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARRDC5A6NEK1 342 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR5H14A6NHG9 310 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 J3QT63 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 BCKDKO14874 412 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LSM1O15116 133 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF13O43567 381 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 COX7A2P2O60397 106 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 POP7O75817 140 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DHRS3O75911 302 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPR75O95800 540 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TTC4O95801 387 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 P01737 135 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 HLA-HP01893 362 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PSKH1P11801 424 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PSMB2P49721 201 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ACTR3P61158 418 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC35A1P78382 337 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 IRF8Q02556 426 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLCXD2Q0VAA5 305 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 PMVKQ15126 192 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DEFB115Q30KQ5 88 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TTMPQ5BVD1 217 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM215Q68D42 235 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 CASC1Q6TDU7 716 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDUFAF7Q7L592 441 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 LINC00596Q86U02 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM228AQ86W67 206 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 JAGN1Q8N5M9 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR2M3Q8NG83 312 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR6K6Q8NGW6 343 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR52E5Q8NH55 327 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR4A5Q8NH83 315 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 UBA3Q8TBC4 463 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 NRGNQ92686 78 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 FBXO32Q969P5 355 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMBIM1Q969X1 311 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms