RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513677.5

GYPB-215, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

TSL 1 (best)

Gene GYPB, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-215	ENST00000513677	GNG3	P63215	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TSPAN31	Q12999	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	AQP3	Q92482	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	STMN2	Q93045	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PRR25	Q96S07	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	RYR2	Q92736	4967 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SELENOF	O60613	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	CST4	P01036	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TK1	P04183	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	FABP3	P05413	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	LYN	P07948	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OPRL1	P41146	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	HAAO	P46952	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PSME3	P61289	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ESRRG	P62508	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ACTA2	P62736	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ACTG2	P63267	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ACTC1	P68032	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ACTA1	P68133	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PYURF	Q96I23	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GYPB-215	ENST00000513677		A6NIN4	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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