RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTG1P62324 171 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GUCA2AQ02747 115 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TESK1Q15569 626 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGFBP7Q16270 282 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIGYQ3MUY2 71 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4K15Q8NH41 348 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR56B4Q8NH76 319 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM222BQ8WU58 562 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ST8SIA4Q92187 359 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2V2Q96R30 315 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf123Q9NWV4 160 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPTNQ9Y639 398 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LAMA5O15230 3695 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0A6YYD4 124 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H0YL77 283 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZG16O60844 167 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCRBP04435 133 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMY2AP04746 511 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTHLHP12272 177 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HLA-DMAP28067 261 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RFX2P48378 723 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADIPOQQ15848 244 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BIVMQ86UB2 503 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRP11Q86VZ4 500 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HOGA1Q86XE5 327 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC107Q8WV48 283 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFT22Q9H7X7 185 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF286AQ9HBT8 521 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C17orf100A8MU93 164 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRAF2O60831 178 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RHBDL1O75783 438 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GOSR1O95249 250 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KNG1P01042 644 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD3DP04234 171 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CFHR2P36980 270 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ECI1P42126 302 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GATA4P43694 442 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNJ3P48549 501 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BCAP31P51572 246 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAB21L1Q13394 359 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EFNB3Q15768 340 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRK1Q15835 563 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C11orf88Q6PI97 169 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6ZR03 302 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BEST4Q8NFU0 473 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC29Q8WV35 223 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OCEL1Q9H607 264 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ETAA1Q9NY74 926 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF7Q9UBF6 113 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AK3Q9UIJ7 227 aa10.37□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2QL1A1L167 161 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.36□□□□□ -0.75
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SHISA9B4DS77 424 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms