RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM17Q86X19 198 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FTMTQ8N4E7 242 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 STARD4Q96DR4 205 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TENM4Q6N022 2769 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MED12LQ86YW9 2145 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5H14A6NHG9 310 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5B21A6NL26 309 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 F8VVB4 439 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 F8VWA3 439 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SMPD2O60906 423 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 LYZL6O75951 148 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TOXO94900 526 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MPC2O95563 127 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CRHP06850 196 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FCGR3AP08637 254 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL3P20749 454 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NPY4RP50391 375 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GPM6AP51674 278 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF12P61328 243 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 9
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T2Q6IF00 324 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZPA2 131 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MKXQ8IYA7 352 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PKIBQ9C010 78 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51I2Q9H344 312 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CDH20Q9HBT6 801 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 EHFQ9NZC4 300 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PR80 420 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNGR1O43759 233 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SFT2D2O95562 160 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV3-15P01624 115 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 RAC2P15153 192 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IL32P24001 234 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 HAAOP46952 286 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1CBP62140 327 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG3P63215 75 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IL13RA1P78552 427 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 OPCMLQ14982 345 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TSC22D1Q15714 1073 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM65Q6PI78 240 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 BRICD5Q6PL45 260 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZS49 121 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF573Q86YE8 665 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 SLAMF9Q96A28 289 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 LIME1Q9H400 295 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV1-44P01699 117 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A4P12235 298 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 AKR1C4P17516 323 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBG1P23258 451 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 GLRA1P23415 457 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 SSTR2P30874 369 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 CALCRP30988 508 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP2-209ENST00000504450 OPRM1P35372 400 aa9.21□□□□□ -0.94
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