RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	SHB	Q15464	509 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR38	Q5JTN6	314 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFI1	Q99684	422 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTGES	O14684	152 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	STATH	P02808	62 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAET1L	Q5VY80	246 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCRL6	Q6DN72	434 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10A2	Q9H208	303 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GTH9	108 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDE6D	O43924	150 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PITX3	O75364	302 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DOB	P13765	273 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	BTG2	P78543	158 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCK2	Q16822	640 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZVL8	140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	EID2B	Q96D98	161 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549		A6NDN8	102 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPRX	A6NFQ7	191 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	AHRR	A9YTQ3	701 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT10B	O00744	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAD51D	O75771	328 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8A	P07357	584 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	DBH	P09172	617 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCR2	P41597	374 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSDHL	Q15738	373 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDS2	O95674	445 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD160	O95971	181 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GYPA	P02724	150 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERPINE2	P07093	398 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ESD	P10768	282 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGC	P20142	388 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCH1	P30793	250 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	VIPR2	P41587	438 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC11A1	P49279	550 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUSD6	Q92537	303 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHODL	Q9H9P2	273 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5B21	A6NL26	309 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf98	E9PRG8	122 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARPC3	O15145	178 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC16A7	O60669	478 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC3A	O75596	197 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTSE	P14091	401 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A1	P53007	311 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBPJ	Q06330	500 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	KMT5C	Q86Y97	462 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM156	Q8N614	296 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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