RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 MRI1Q9BV20 369 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SIRPDQ9H106 197 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 DUSP21Q9H596 190 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 CELP19835 753 aa7.2□□□□□ -1.26
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ITGB1-217ENST00000494395 ARF6P62330 175 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 COL10A1Q03692 680 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 LSAMPQ13449 338 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q499Y3 187 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.2□□□□□ -1.26
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