RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.09□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 PPP1R1AQ13522 171 aa6.09□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 C10orf128Q5T292 105 aa6.09□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PRR13Q9NZ81 148 aa6.09□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 C5orf52A6NGY3 159 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF32P17041 273 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 NPY4RP50391 375 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HGFACQ04756 655 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM225BP0DP42 221 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MGMTP16455 207 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF561Q8N587 486 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.08□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 OR10A2Q9H208 303 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CEP250Q9BV73 2442 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 A0A096LPE4 126 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.07□□□□□ -1.44
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