RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 ZNF626Q68DY1 528 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 ZNF676Q8N7Q3 588 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 OR10AC1Q8NH08 325 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 NDNFQ8TB73 568 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 FGGYQ96C11 551 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 SNX22Q96L94 193 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa13.15□□□□□ -0.3
RBM3-211ENST00000491240 A6NDX4 124 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PLXNB1O43157 2135 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ENTPD6O75354 484 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ZNF20P17024 532 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ATF1P18846 271 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RBP2P50120 134 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR12D2P58182 307 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CDC42P60953 191 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ZNF91Q05481 1191 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR2G2Q8NGZ5 317 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RPS4Y2Q8TD47 263 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CFHR4Q92496 578 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 MALSU1Q96EH3 234 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RNFT2Q96EX2 444 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 hADV38S2A0JD32 116 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 VGLL3A8MV65 326 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 F2RL2O00254 374 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 FBXO24O75426 580 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CIB2O75838 187 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OCM2P0CE71 109 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CD24P25063 80 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PEX2P28328 305 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RASSF2P50749 326 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ISL1P61371 349 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 BLCAPP62952 87 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 SCN1BQ07699 218 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RFKQ969G6 155 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 FRRS1LQ9P0K9 344 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.13□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 DAPL1A0PJW8 107 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 J3QLW9 94 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PEX14O75381 377 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CYB5AP00167 134 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 IGKV1D-12P01611 117 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OPN1MWP04001 364 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ZNF19P17023 458 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR3A1P47881 315 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 TMEM244Q5VVB8 128 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 C11orf88Q6PI97 169 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 A0A0G2JK05 382 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 A0A1W2PRX2 142 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 EI24O14681 340 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 HTR1AP08908 422 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 TMED1Q13445 227 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 CCDC54Q8NEL0 328 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR13C3Q8NGS6 347 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PP6455Q8WZ26 134 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 R3HDM4Q96D70 268 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 C4orf36Q96KX1 117 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OPALINQ96PE5 141 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 PRSS22Q9GZN4 317 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 MMP28Q9H239 520 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 NEK6Q9HC98 313 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.11□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.1□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 MGST3O14880 152 aa13.1□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 ATP5HO75947 161 aa13.1□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 OR2H2O95918 312 aa13.1□□□□□ -0.31
RBM3-211ENST00000491240 RBP4P02753 201 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms