RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, human

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989		V9GYH0	126 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989		H3BUI4	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SOCS1	O15524	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PTH2R	P49190	550 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF45	Q02386	682 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HFE	Q30201	348 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989		Q6P435	159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CCL17	Q92583	94 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ARID1A	O14497	2285 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LGALS8	O00214	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PSG2	P11465	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	DAO	P14920	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GABRR1	P24046	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LMO1	P25800	156 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CHAT	P28329	748 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CD80	P33681	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	FBN2	P35556	2912 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TAS2R20	P59543	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SEH1L	Q96EE3	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LIME1	Q9H400	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	MFNG	O00587	321 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	NDUFS7	O75251	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PDCD6	O75340	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GLA	P06280	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	MELTF	P08582	738 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	FUT3	P21217	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF79	Q15937	498 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	STUM	Q69YW2	141 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989		A0A0G2JMP0	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989		A0A0X1KG70	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SH2D1B	O14796	132 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CTDSPL	O15194	276 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	CA11	O75493	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LY6H	O94772	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HAND1	O96004	215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	DUSP1	P28562	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	GMFB	P60983	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CLDN11-208	ENST00000488989	IKZF1	Q13422	519 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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