RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480357.5

SCLY-215, Transcript of selenocysteine lyase, human

TSL 1 (best)

Gene SCLY, Length 5,668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCLY-215	ENST00000480357	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	PPP1CB	P62140	327 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	HRAS	P01112	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CXCL3	P19876	107 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357		Q56UQ5	140 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	FBP1	P09467	338 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	VAMP3	Q15836	100 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	OR6S1	Q8NH40	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	GAL	P22466	123 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	RAC3	P60763	192 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	POU2F2	P09086	479 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SPP1	P10451	314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TMEM33	P57088	247 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	GPA33	Q99795	319 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	POLE	Q07864	2286 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SCLY-215	ENST00000480357	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	CDIPT	O14735	213 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	KCNJ3	P48549	501 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	HPX	P02790	462 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357		A0A1W2PPV9	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357		M0QZ24	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	S100A8	P05109	93 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	CCL3	P10147	92 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	MAGEA5	P43359	124 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	PECR	Q9BY49	303 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	CYC1	P08574	325 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	SLC6A1	P30531	599 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	HFE	Q30201	348 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	LAMB1	P07942	1786 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	CYR61	O00622	381 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SCLY-215	ENST00000480357	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms