RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MYDGFQ969H8 173 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ORAI1Q96D31 301 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.22■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQ09 198 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 TMEM82A0PJX8 343 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 HAND1O96004 215 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PRKACAP17612 351 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF146Q15072 292 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 FAM185AQ8N0U4 392 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SPATA3Q8NHX4 192 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 ZFAND2BQ8WV99 257 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 DUSP21Q9H596 190 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 HMG20AQ9NP66 347 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 SIRT7Q9NRC8 400 aa17.21■□□□□ 0.35
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa17.21■□□□□ 0.35
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ACTB-211ENST00000480301 M0R1W7 72 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-69P01742 117 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TMEM225BP0DP42 221 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CELP19835 753 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DUSP1P28562 367 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 IRF3Q14653 427 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 Q499Y3 187 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 C17orf107Q6ZR85 190 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
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ACTB-211ENST00000480301 OR52N4Q8NGI2 321 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF14Q92956 283 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SNX22Q96L94 193 aa17.2■□□□□ 0.34
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ACTB-211ENST00000480301 PRDM13Q9H4Q3 707 aa17.2■□□□□ 0.34
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ACTB-211ENST00000480301 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.2■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB3O15480 346 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GPX5O75715 221 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 ALDOBP05062 364 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SNU13P55769 128 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DLX1P56177 255 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 RPL31P62899 125 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 BDH1Q02338 343 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 ACSM1Q08AH1 577 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SPIN3Q5JUX0 258 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TMEM200BQ69YZ2 307 aa17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR5M11Q96RB7 305 aa17.19■□□□□ 0.34
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ACTB-211ENST00000480301 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TRIM77I1YAP6 450 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GABRPO00591 440 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CRHBPP24387 322 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 VHLP40337 213 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 UBA52P62987 128 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 BAMBIQ13145 260 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SATL1Q86VE3 508 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 C11orf42Q8N5U0 333 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PXT1Q8NFP0 134 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CNBD2Q96M20 576 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR14A2Q96R54 314 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TMEM138Q9NPI0 162 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.18■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PSPNO60542 156 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PRTN3P24158 256 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PPP3R1P63098 170 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SPHARQ15513 63 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 ASCL4Q6XD76 172 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR8H2Q8N162 312 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR5D13Q8NGL4 314 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 FAM216AQ8WUB2 273 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 GPER1Q99527 375 aa17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPK0 400 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 SH2D1BO14796 132 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 RGS10O43665 173 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 BDKRB2P30411 391 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 KLRD1Q13241 179 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 BLMHQ13867 455 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 ZNF273Q14593 569 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 ELP2Q6IA86 826 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 OR4S1Q8NGB4 309 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.16■□□□□ 0.34
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