RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 HAUS1Q96CS2 278 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM15Q9C019 465 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM38AQ9H6F2 299 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 TREM1Q9NP99 234 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 XCL2Q9UBD3 114 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.1□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6C74A6NCV1 312 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A20A6NK97 555 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 E7EQ34 232 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 BIRC5O15392 142 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 E2F6O75461 281 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 HSBP1O75506 76 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SNAPINO95295 136 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMG1O95456 288 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 HBE1P02100 147 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 IDO1P14902 403 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 RFC3P40938 356 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SLCO1A2P46721 670 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINB8P50452 374 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC18A1P54219 525 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR176Q14439 515 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF726P1Q15940 193 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 GSG1Q2KHT4 349 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SPINK14Q6IE38 97 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 OR51F2Q8NH61 342 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 UBA3Q8TBC4 463 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC1AQ92747 370 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGDIGQ99819 225 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 AIG1Q9NVV5 245 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 ADA2Q9NZK5 511 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 Q9UF83 564 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX24Q9Y343 169 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.09□□□□□ -1.75
STRADBP1-201ENST00000478954 NCKAP5O14513 1909 aa4.09□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GVG6 124 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SMKR1H3BMG3 65 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 K7EMT4 169 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 PLPP1O14494 284 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 GYG2O15488 501 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBP6O75344 327 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 ENTPD5O75356 428 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 ETHE1O95571 254 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINA7P05543 415 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNOP22674 350 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 TEAD1P28347 426 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 FMO3P31513 532 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 Q1RN00 199 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA24Q86W54 205 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 NAT14Q8WUY8 206 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf50Q8WW18 174 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 BAALCQ8WXS3 180 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 NRBF2Q96F24 287 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SNF8Q96H20 258 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 PAXXQ9BUH6 204 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SRMSQ9H3Y6 488 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 Q9H521 79 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CLN6Q9NWW5 311 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 MED29Q9NX70 200 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.08□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 HERC1Q15751 4861 aa4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GVI7 797 aa4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMB11A5LHX3 300 aa4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
STRADBP1-201ENST00000478954 EDF1O60869 148 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms