RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 BAMBIQ13145 260 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 Q499Y3 187 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 OR8H2Q8N162 312 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 TMEM86BQ8N661 226 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CHST4Q8NCG5 386 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 PXT1Q8NFP0 134 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 NRG4Q8WWG1 115 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GHSRQ92847 366 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 LHX4Q969G2 390 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 HMG20AQ9NP66 347 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 HAX1O00165 279 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZNF737O75373 536 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GPX5O75715 221 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 HAND1O96004 215 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CDK1P06493 297 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 TMEM225BP0DP42 221 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SELLP14151 372 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 BCL3P20749 454 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 UBE2E1P51965 193 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 UBA52P62987 128 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ACTG1P63261 375 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 XAF1Q6GPH4 301 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ELP2Q6IA86 826 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CDH26Q8IXH8 852 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 FAM185AQ8N0U4 392 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MS4A15Q8N5U1 240 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GPER1Q99527 375 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 hADV38S2A0JD32 116 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MGST3O14880 152 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 PRKACAP17612 351 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 LMO1P25800 156 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SOX2P48431 317 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MTNR1BP49286 362 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GPR50Q13585 617 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MIDNQ504T8 468 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 Q6YL49 198 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 FGFRL1Q8N441 504 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 Q8N7P7 452 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 S100A13Q99584 98 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 PTGES3LE9PB15 166 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 F8VVB4 439 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 F8VWA3 439 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FBP1P09467 338 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CELP19835 753 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FSTP19883 344 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 BDKRB2P30411 391 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 NPBWR2P48146 333 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 EDDM3BP56851 147 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ERVFRD-1P60508 538 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZP1P60852 638 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 GPR176Q14439 515 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 Q8NFD4 153 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SPACA5Q96QH8 159 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 ESM1Q9NQ30 184 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 IL36GQ9NZH8 169 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 RAB26Q9ULW5 256 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 FOXJ3Q9UPW0 622 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 LINC00312Q9Y6C7 94 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-211ENST00000476336 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms