RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 H0YIZ8 118 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 BCKDHBP21953 392 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 MMP16P51512 607 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ROM1Q03395 351 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 C1orf100Q5SVJ3 147 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 LEMD1Q68G75 181 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RNF126Q9BV68 326 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PLEK2Q9NYT0 353 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM221AA4D161 298 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 C17orf51A8MQB3 221 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 DVL1O14640 695 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 BGLAPP02818 100 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHRNA7P36544 502 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCK2Q16822 640 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPH3ALQ9UNE2 315 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 A8MXE2 369 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PLPP3O14495 311 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 MGST1P10620 155 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FOLR2P14207 255 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CDAP32320 146 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RELQ04864 619 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLN3Q13286 438 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR1P1Q8NH06 330 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FRG2CA6NGY1 282 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 TAS2R30P59541 319 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM69BQ5VUD6 431 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM9BQ9NQ34 198 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 GCGP01275 180 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PMCHP20382 165 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ECI1P42126 302 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 GABRA4P48169 554 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FUT7Q11130 342 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FZD2Q14332 565 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 FDX2Q6P4F2 183 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 DOK3Q7L591 496 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRRC18Q8N456 261 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 VN1R1Q9GZP7 353 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 WWTR1Q9GZV5 400 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 WBP1LQ9NX94 342 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 UNC13CQ8NB66 2214 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 RNF212BA8MTL3 300 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 MPV17LQ2QL34 196 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC38A9Q8NBW4 561 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CORO2AQ92828 525 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 BORCS8Q96FH0 119 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 MMACHCQ9Y4U1 282 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 DENND4CQ5VZ89 1909 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 F8VVB4 439 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 F8VWA3 439 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 H0Y8G0 127 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 C2orf88Q9BSF0 95 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 BET1LQ9NYM9 111 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BKO60814 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF205O95201 554 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 CFIP05156 583 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BJP06899 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BOP23527 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BBP33778 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BDP58876 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BCP62807 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF90Q03938 601 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM156Q8N614 296 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 GCM1Q9NP62 436 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP5L-202ENST00000475978 HLA-GP17693 338 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 UNC119Q13432 240 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 PHYHD1Q5SRE7 291 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 BIVMQ86UB2 503 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 GKN2Q86XP6 184 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 LRRC75AQ8NAA5 344 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5C1Q8NGR4 320 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PPV4 95 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 AQP7P3A6NL99 342 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 SHISA8B8ZZ34 492 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAMP1O60894 148 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms