RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 RAB3CQ96E17 227 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0B4J2E0 115 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GX12 115 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CLDN1O95832 211 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 S100PP25815 95 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GNRHRP30968 328 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 THBS2P35442 1172 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R31P59538 309 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HERV-K104P61576 105 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 S100A12P80511 92 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ACKR1Q16570 336 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 WDR38Q5JTN6 314 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZT83 130 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PGAP1Q75T13 922 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC18Q8N456 261 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR1S1Q8NH92 325 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PLK3Q9H4B4 646 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CHODLQ9H9P2 273 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CADP27708 2225 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 A6NLC8 198 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OGG1O15527 345 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ADAP1O75689 374 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NXPH3O95157 252 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GOSR1O95249 250 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SFTA3P0C7M3 94 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GPR157Q5UAW9 335 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FADS6Q8N9I5 356 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 STARD4Q96DR4 205 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PIN1P1O15428 100 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LY86O95711 162 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 Q5PR19 223 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LYG2Q86SG7 212 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 BATF2Q8N1L9 274 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MUC15Q8N387 334 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 KCNK17Q96T54 332 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SOSTQ9BQB4 213 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 JAM3Q9BX67 310 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 B9D1Q9UPM9 204 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR5H1A6NKK0 313 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 C17orf51A8MQB3 221 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 THY1P04216 161 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RPA2P15927 270 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CRABP1P29762 137 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ARR3P36575 388 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SKP2Q13309 424 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 EMC4Q5J8M3 183 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SSX9Q7RTT3 188 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms