RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RLN1	P04808	185 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNA6	P05013	189 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FCGR3A	P08637	254 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PTAFR	P25105	342 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNB4	P30926	498 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		Q8IYB0	196 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ATM	Q13315	3056 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	LAMA5	O15230	3695 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		A6NLC8	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435		H3BUI4	141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ABCD4	O14678	606 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CDIPT	O14735	213 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DTYMK	P23919	212 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PMEL	P40967	661 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ST3GAL2	Q16842	350 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MED28	Q9H204	178 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM221A	A4D161	298 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NXPH2	O95156	264 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	IL5	P05113	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	DUSP1	P28562	367 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CD200	P41217	278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR3A3	P47888	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ARPC4	P59998	168 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CD83	Q01151	205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FCN2	Q15485	313 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPB6	O14558	160 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	SSNA1	O43805	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	HPX	P02790	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF44	P15621	663 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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