RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 C12orf57Q99622 126 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 IL36GQ9NZH8 169 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 MBD2Q9UBB5 411 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 KIF25Q9UIL4 384 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 A0A0D9SG52 128 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 WISP2O76076 250 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ATG12O94817 140 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 IL18BPO95998 194 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 TNFSF10P50591 281 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 CCL11P51671 97 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 B2MP61769 119 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 PRDX4Q13162 271 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 FAM219AQ8IW50 185 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ZFP82Q8N141 532 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 THAP6Q8TBB0 222 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 SLC22A20A6NK97 555 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 OR2F2O95006 317 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 OR5H8P0DN80 308 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 COX5BP10606 129 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 SPINK2P20155 84 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 PSMB6P28072 239 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 CALCRP30988 508 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ARR3P36575 388 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 GPM6AP51674 278 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 OR2F1Q13607 317 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 TECTBQ96PL2 329 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 OR51B6Q9H340 312 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 F8VVB4 439 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 F8VWA3 439 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 PTGER4P35408 488 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 HAAOP46952 286 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 SOX8P57073 446 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 MALLQ13021 153 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ZNF345Q14585 488 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 Q6ZPA2 131 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 LRRC46Q96FV0 321 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 OR10C1Q96KK4 312 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 EDARQ9UNE0 448 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 BCL3P20749 454 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 PLP2Q04941 152 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 SLAMF9Q96A28 289 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ZNF75AQ96N20 296 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 RNF126Q9BV68 326 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 NMES1Q9C002 83 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 RAB18Q9NP72 206 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 H0YIZ8 118 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 LILRA1O75019 489 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 PDCD6O75340 191 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 HOXB5P09067 269 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 DTYMKP23919 212 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 CD82P27701 267 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 WNT5AP41221 380 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 OR1K1Q8NGR3 316 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 LAMA5O15230 3695 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 A0A0B4J2A0 478 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 CLN3Q13286 438 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 SLC22A25Q6T423 547 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 BVESQ8NE79 360 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 OR1S1Q8NH92 325 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 TOMM40LQ969M1 308 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.82□□□□□ -0.84
HPS1-208ENST00000467246 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms