RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.98■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 VSIG4Q9Y279 399 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.98■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.98■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 SCO1O75880 301 aa15.97■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 PHB2Q99623 299 aa15.97■□□□□ 0.15
CAPN3-209ENST00000466222 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.97■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 C1QL1O75973 258 aa15.96■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 ST8SIA2Q92186 375 aa15.96■□□□□ 0.15
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CAPN3-209ENST00000466222 BCL2L11O43521 198 aa15.96■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 AWAT2Q6E213 333 aa15.96■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF843Q8N446 348 aa15.96■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.96■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 SPSB4Q96A44 273 aa15.96■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 SPACA5Q96QH8 159 aa15.96■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 C9orf170A2RU37 121 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 IFNA6P05013 189 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 NAT1P18440 290 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.95■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 SPDEFO95238 335 aa15.94■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 UBE2V2Q15819 145 aa15.94■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.94■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 PXT1Q8NFP0 134 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 RASL12Q9NYN1 266 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 XRCC2O43543 280 aa15.94■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 ASCL1P50553 236 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 IL13RA1P78552 427 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 NAAAQ02083 359 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R1AQ13522 171 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 CST11Q9H112 138 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 FZR1Q9UM11 496 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 RLN2P04090 185 aa15.93■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 CBX5P45973 191 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 MALLQ13021 153 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR5AS1Q8N127 324 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.93■□□□□ 0.14
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CAPN3-209ENST00000466222 THAP6Q8TBB0 222 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 GPR173Q9NS66 373 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 POM121CA8CG34 1229 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 HRH1P35367 487 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1CBP62140 327 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 OR8B8Q15620 311 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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