RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5D18Q8NGL1 313 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GHSRQ92847 366 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MYDGFQ969H8 173 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GPER1Q99527 375 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PPE2 198 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PR64 198 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1W2PRV1 198 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ANGPTL7O43827 346 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM4BO94953 1096 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 HAND1O96004 215 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM225BP0DP42 221 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 YIF1BQ5BJH7 314 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 Q8N7P7 452 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF485Q8NCK3 441 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A28Q96A46 364 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SNX22Q96L94 193 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 HMG20AQ9NP66 347 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 NOX4Q9NPH5 578 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PTGES3LE9PB15 166 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CLDN34H7C241 214 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SH2D1BO14796 132 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF737O75373 536 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CDK1P06493 297 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MYF6P23409 242 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GABRR1P24046 479 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 BMXP51813 675 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 EDDM3BP56851 147 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF146Q15072 292 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 Q499Y3 187 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF529Q6P280 563 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SATL1Q86VE3 508 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR8H2Q8N162 312 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 DUX5Q96PT3 197 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MND1Q9BWT6 205 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD60Q9BZ19 345 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 IL36RNQ9UBH0 155 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CKLFQ9UBR5 152 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM96BQ9Y3D0 163 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV1D-12P01611 117 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDOBP05062 364 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CALCBP10092 127 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CELP19835 753 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP1P28562 367 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ZP1P60852 638 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 BDH1Q02338 343 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 RIPK1Q13546 671 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 GRK1Q15835 563 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 RNLSQ5VYX0 342 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF144BQ7Z419 303 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PXT1Q8NFP0 134 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 THRSPQ92748 146 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM138Q9NPI0 162 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP6V1G2O95670 118 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 CD1AP06126 327 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 BDKRB2P30411 391 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MTNR1BP49286 362 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2E1P51965 193 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 KLRD1Q13241 179 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 EDDM3AQ14507 147 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-205ENST00000466097 DDI2Q5TDH0 399 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms