RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 LYZP61626 148 aa15.18■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 ADAP1O75689 374 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 CSF2RBP32927 897 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 RAB7AP51149 207 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 Q1RN00 199 aa15.16■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 HSBP1O75506 76 aa15.16■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
PTPRF-209ENST00000438120 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.16■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.16■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.15■□□□□ 0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 OR5B21A6NL26 309 aa15.14■□□□□ 0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 CHRNA7P36544 502 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRF-209ENST00000438120 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM65Q6PI78 240 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PN81 502 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRF-209ENST00000438120 SPP1P10451 314 aa15.14■□□□□ 0.01
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