RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXC2Q99958 501 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 NICN1Q9BSH3 213 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMES1Q9C002 83 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 BANF2Q9H503 90 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR35Q9HC97 309 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB18Q9NP72 206 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFP57Q9NU63 452 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 EHFQ9NZC4 300 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL36GQ9NZH8 169 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUP50Q9UKX7 468 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 VSIG4Q9Y279 399 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTTNQ86VV8 2226 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0G2JMM0 328 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PPB8 328 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PRS3 328 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR14I1A6ND48 311 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 C5orf51A6NDU8 294 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF724A8MTY0 619 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM25EA8MYX2 175 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 I3L521 148 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 SOCS1O15524 211 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL2L11O43521 198 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSX5O60225 188 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPC2O95563 127 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRASP01111 189 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 RRASP10301 218 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGAM2P15259 253 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOSL1P15407 271 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL2P19875 107 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 GABRR1P24046 479 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 STARP49675 285 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMCO1Q147U7 214 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOR2AQ5JU69 321 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR52W1Q6IF63 320 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF774Q6NX45 483 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM104Q8NE00 496 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 PXT1Q8NFP0 134 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPRL2Q8WTW4 380 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ST8SIA4Q92187 359 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO17Q96EF6 278 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYZL4Q96KX0 146 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q96M66 194 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPACA5Q96QH8 159 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 PECRQ9BY49 303 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCO1Q9HAY6 547 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 GP6Q9HCN6 339 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 RDH8Q9NYR8 311 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF224Q9NZL3 707 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAB1Q9NY15 2570 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2AT4A6NND4 320 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1P1-201ENST00000437111 LEUTXA8MZ59 168 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms