RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM74A7A6NL05 159 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NKX2-8O15522 239 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAPC5O75971 98 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINA7P05543 415 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NME2P22392 152 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ACKR3P25106 362 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 MEOX1P50221 254 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 PSG4Q00888 419 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF92Q03936 586 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 C4orf17Q53FE4 359 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2T2Q6IF00 324 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 EML5Q05BV3 1969 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ALDH3B1P43353 468 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 VAMP3Q15836 100 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR54Q9H977 334 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 MPTX1A8MV57 137 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SRD5A2P31213 254 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 CAV2P51636 162 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SSPNQ14714 243 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 DCAF10Q5QP82 559 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 WNT2BQ93097 391 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 BCO1Q9HAY6 547 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5H8P0DN80 308 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 PXT1Q8NFP0 134 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 M1APQ8TC57 530 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf170A2RU37 121 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFS8O00217 210 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR31O00270 319 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 FCGR2CP31995 323 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 APLNRP35414 380 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 LYG2Q86SG7 212 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf172C9J069 976 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD17B6O14756 317 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 NGFP01138 241 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRM2P08172 466 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SP9P0CG40 484 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CD46P15529 392 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ECH1Q13011 328 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC10A1Q14973 349 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 MPPED2Q15777 294 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A28Q96A46 364 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIB1Q96RU8 372 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 HPNP05981 417 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 OR51H1Q8NH63 302 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 C20orf202A1L168 122 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-13P01766 116 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-7P01780 117 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CRYBA1P05813 215 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2M7Q8NG81 312 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 LYZL4Q96KX0 146 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 OR51M1Q9H341 326 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 IGF2RP11717 2491 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPB2A8KAH6 182 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF732B4DXR9 585 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 S100GP29377 79 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 NTF4P34130 210 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5I1Q13606 314 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 PPA1Q15181 289 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms