RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF126Q9BV68 326 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A0B4J2A0 478 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCGR2CP31995 323 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERVS71-1P61550 626 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MALLQ13021 153 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGSF11Q5DX21 431 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SELEP16581 610 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIGPP57054 158 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM65Q6PI78 240 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASCL4Q6XD76 172 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR1S1Q8NH92 325 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00052Q96N35 136 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACACAQ13085 2346 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A0D9SG52 128 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD300LBA8K4G0 201 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDCD6O75340 191 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACTL6AO96019 429 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A4P12235 298 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ELP2Q6IA86 826 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PXT1Q8NFP0 134 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC20Q8TCA0 184 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEK7Q8TDX7 302 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIB1Q96RU8 372 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REG4Q9BYZ8 158 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CACNA1DQ01668 2161 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCL2L11O43521 198 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CA6P23280 308 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APLNRP35414 380 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARL6IP1Q15041 203 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRN1LQ496H8 165 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF25Q9UIL4 384 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSF4Q9ULV5 492 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2F2O95006 317 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCGB1D2O95969 90 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IKZF1Q13422 519 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2F1Q13607 317 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DEFB109BQ30KR1 87 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GALNT11Q8NCW6 608 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASB13Q8WXK3 278 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.87□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HS3ST1O14792 307 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BET1O15155 118 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHBDL1O75783 438 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFNA2P01563 188 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FUT3P21217 361 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARR3P36575 388 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLEC9AQ6UXN8 241 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EXTL1Q92935 676 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAB18Q9NP72 206 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNMB2Q9Y691 235 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRYZL1O95825 349 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5AC1P0C628 307 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF728P0DKX0 622 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CALCRP30988 508 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.86□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms