RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV1D-33P01593 117 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV1-33P01594 117 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 H2BFMP0C1H6 154 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MPZP25189 248 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PRRX1P54821 245 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF573Q86YE8 665 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 Q8N9W7 124 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR2T12Q8NG77 320 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 RPEQ96AT9 228 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 KCTD7Q96MP8 289 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TMED9Q9BVK6 235 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GHITMQ9H3K2 345 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 VSIG4Q9Y279 399 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DNAH2Q9P225 4427 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087X0M5 115 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1B0GX30 115 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HSPA12AO43301 675 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 SPI1P17947 270 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ISL1P61371 349 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 EBI3Q14213 229 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 Q8N6K4 173 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CORO2AQ92828 525 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TOMM40LQ969M1 308 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 C7orf26Q96N11 449 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 INMTO95050 263 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 NRASP01111 189 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV1-51P01701 117 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV3-7P01780 117 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GABRR1P24046 479 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PEX2P28328 305 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DUSP1P28562 367 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR3A1P47881 315 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GSSP48637 474 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PMS2P11Q13670 270 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 CRMP1Q14194 572 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ASRGL1Q7L266 308 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 RNF148Q8N7C7 305 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 LEAP2Q969E1 77 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 C7orf34Q96L11 122 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR4C12Q96R67 309 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MNTQ99583 582 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TUBA4BQ9H853 241 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GPR173Q9NS66 373 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 U3KQV3 271 aa9.1□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 MGST3O14880 152 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV1-40P01703 118 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR8U9P0C7N5 309 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 KIR3DL2P43630 455 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 GLIPR1P48060 266 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 P2RX3P56373 397 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 OR51J1Q9H342 316 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 NIPAL2Q9H841 368 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.09□□□□□ -0.95
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.08□□□□□ -0.96
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WW49 117 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms