RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 LINC00473A8K010 186 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 H3BSH0 61 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 SULT1C2O00338 296 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G10O15496 165 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 SLC6A1P30531 599 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 FTMTQ8N4E7 242 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 FGGYQ96C11 551 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.59□□□□□ -1.51
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CCL20-202ENST00000409189 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 ARL6IP1Q15041 203 aa5.58□□□□□ -1.52
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CCL20-202ENST00000409189 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZT83 130 aa5.58□□□□□ -1.52
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CCL20-202ENST00000409189 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 UPRTQ96BW1 309 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 TRIB1Q96RU8 372 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 RNF121Q9H920 327 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 ETAA1Q9NY74 926 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 RAB22AQ9UL26 194 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.58□□□□□ -1.52
CCL20-202ENST00000409189 MED12Q93074 2177 aa5.57□□□□□ -1.52
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