RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf64Q5T6V5 341 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf135Q5VTT2 229 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 UBE2UQ5VVX9 321 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GPR107Q5VW38 600 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 DCUN1D2Q6PH85 259 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO36Q8NEA4 188 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 OR4C5Q8NGB2 326 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 OR51L1Q8NGJ5 315 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 OR51A7Q8NH64 312 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 DTD1Q8TEA8 209 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 LCN9Q8WX39 176 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ING5Q8WYH8 240 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SLC7A6Q92536 515 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2H4Q92759 462 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HGDQ93099 445 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TOP1MTQ969P6 601 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM203Q969S6 136 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SMIM8Q96KF7 97 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 CNBD2Q96M20 576 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GLT1D1Q96MS3 346 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF285Q96NJ3 590 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP2□□□□□ -2.091e-6■■■■■ 33.2
PTPRC-205ENST00000391970 CHP1Q99653 195 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 BBS2Q9BXC9 721 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 REG4Q9BYZ8 158 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 EFCAB1Q9HAE3 211 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 WFDC1Q9HC57 220 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF160Q9HCG1 818 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF302Q9NR11 478 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MCUBQ9NWR8 336 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SLX4Q8IY92 1834 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1B0GV90 55 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 OR2AT4A6NND4 320 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 KCNK1O00180 336 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 CDIPTO14735 213 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 UBDO15205 165 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 CHST1O43916 411 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TPST1O60507 370 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 PLIN3O60664 434 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 EDF1O60869 148 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SPAG7O75391 227 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TDP2O95551 362 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 AIFM1O95831 613 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 IFNA17P01571 189 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HLA-DQB1P01920 261 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HTR1AP08908 422 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 METTL15P1P0C7V9 234 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HLA-EP13747 358 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SRMP19623 302 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HLA-DMAP28067 261 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MAS1LP35410 378 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TGFBR2P37173 567 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEA2P43356 314 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF136P52737 540 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 RPS15P62841 145 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 EMX2Q04743 252 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 PRKCDQ05655 676 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MERTKQ12866 999 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 CLINT1Q14677 625 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB6Q15916 424 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 IMPG1Q17R60 797 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TPRG1LQ5T0D9 272 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 C10orf91Q5T1B1 145 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 FAM71E1Q6IPT2 247 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 Q6P435 159 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 TEX261Q6UWH6 196 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 LRRN1Q6UXK5 716 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 SPNS3Q6ZMD2 512 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF493Q6ZR52 646 aa1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
PTPRC-205ENST00000391970 STRADAQ7RTN6 431 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms