RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SMCO3A2RU48 225 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY10O00398 339 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP3O14495 311 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DVL1O14640 695 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ST8SIA3O43173 380 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HCRTR2O43614 444 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CD63P08962 238 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ST6GAL1P15907 406 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IL12BP29460 328 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MPLP40238 635 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AKR1C3P42330 323 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TLE4Q04727 773 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf35Q96D05 121 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RAB39BQ96DA2 213 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CMBLQ96DG6 245 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ARSGQ96EG1 525 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SPIN2AQ99865 258 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPE2 198 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 WIPF3A6NGB9 483 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF878C9JN71 531 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NME2P1O60361 137 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB7O75200 414 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TTRP02766 147 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ARG1P05089 322 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NR2C1P13056 603 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PVRP15151 417 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SFTPDP35247 375 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CD226Q15762 336 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KHDC3LQ587J8 217 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DOK3Q7L591 496 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 STPG3Q8N7X2 389 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DOK4Q8TEW6 326 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MR1Q95460 341 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GNRHR2Q96P88 292 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TGM7Q96PF1 710 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GPER1Q99527 375 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MPDZO75970 2070 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf47A7E2U8 309 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 H0YIG0 161 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 H3BQ15 152 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HCRTR1O43613 425 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 YIF1AO95070 293 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CDS2O95674 445 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT14O95848 222 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HEXBP07686 556 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HCKP08631 526 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MMP9P14780 707 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FOLR1P15328 257 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 PAX1P15863 534 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 GLIPR1P48060 266 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR1D5P58170 312 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 DLK1P80370 383 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TLE1Q04724 770 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ELOBQ15370 118 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.27□□□□□ -1.41
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