RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 CD8AP01732 235 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GNB3P16520 340 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FUT3P21217 361 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP1P28562 367 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS3P35030 304 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GNG2P59768 71 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ERVK11-1P61568 191 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PDCD1Q15116 288 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MICBQ29980 383 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SPRNQ5BIV9 151 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N402 240 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 C14orf79Q96F83 325 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CCL19Q99731 98 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PECRQ9BY49 303 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SRRQ9GZT4 340 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HES4Q9HCC6 221 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DLL4Q9NR61 685 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 NLKQ9UBE8 527 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 EDARQ9UNE0 448 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4EA0A075B759 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0A6YYD4 124 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINE3A8MV23 424 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4DF5H284 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GABARAPH6UMI1 98 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SULT1C2O00338 296 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HAND1O96004 215 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HPXP02790 462 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CD3GP09693 182 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GSTT2BP0CG30 244 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SSTR2P30874 369 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CD80P33681 288 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CDKN1AP38936 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PMELP40967 661 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GABRA2P47869 451 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PTH2RP49190 550 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ8Q15842 424 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF79Q15937 498 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RDH5Q92781 318 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SOSTQ9BQB4 213 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 WDR13Q9H1Z4 485 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IFT46Q9NQC8 304 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HSF4Q9ULV5 492 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM235A6NFC5 223 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OOEPA6NGQ2 149 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OR2AT4A6NND4 320 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 C3orf80F5H4A9 247 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM178BH3BS89 294 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SIRPB1O00241 398 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RBBP9O75884 186 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OR2H2O95918 312 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LHBP01229 141 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DQB1P01920 261 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DAOP14920 347 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 EGR1P18146 543 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 COL8A1P27658 744 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ACTBP60709 375 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ACTG1P63261 375 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF146Q15072 292 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BIVMQ86UB2 503 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TIMD4Q96H15 378 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD1Q96SE0 405 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms