RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SEC16AO15027 2179 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 M0R135 149 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PLPP1O14494 284 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 HRH1P35367 487 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PRDX4Q13162 271 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FAM57BQ71RH2 274 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF799Q96GE5 643 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GPR84Q9NQS5 396 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 KNTC1P50748 2209 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf51A8MQB3 221 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PPP6CO00743 305 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SP1P08047 785 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 BCL3P20749 454 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CA7P43166 264 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR3A1P47881 315 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GPM6AP51674 278 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR5M11Q96RB7 305 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GNG12Q9UBI6 72 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 STARD10Q9Y365 291 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 LANCL1O43813 399 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GLRA1P23415 457 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SHEQ5VZ18 495 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FAM166AQ6J272 317 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 MRGPREQ86SM8 312 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 M0QZ24 198 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 P2RY10O00398 339 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 AQP7O14520 342 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR2A4O95047 310 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R60P59551 318 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PNKDQ8N490 385 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR2A7Q96R45 310 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA7A6NL88 538 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 A8MWL6 223 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 H0YGG7 62 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 COX7A2P2O60397 106 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CDC14BO60729 498 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR13C7P0DN81 318 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 COX5BP10606 129 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ARNTP27540 789 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FOXA1P55317 472 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 HERPUD1Q15011 391 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 RLN3Q8WXF3 142 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM45BQ96B21 275 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SSSCA1O60232 199 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF737O75373 536 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PRRX1P54821 245 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 RAC3P60763 192 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PIGFQ07326 219 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN3Q16667 212 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 LILRA6Q6PI73 481 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 IL19Q9UHD0 177 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 V9GYH0 126 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0U1RQK1 487 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF320A2RRD8 509 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PTNP21246 168 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PGGT1BP53609 377 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS3P57727 454 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms