RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 OR4E1P0C645 316 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ERP29P30040 261 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 HAAOP46952 286 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PRDX4Q13162 271 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CDH26Q8IXH8 852 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SPSB1Q96BD6 273 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CD300LBA8K4G0 201 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 L7N2F9 121 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 XRCC2O43543 280 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 HOXC12P31275 282 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 Q6ZPA2 131 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ST8SIA4Q92187 359 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 C10orf35Q96D05 121 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 EHFQ9NZC4 300 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 COMMD9Q9P000 198 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SYNGR1O43759 233 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 UBBP0CG47 229 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF35P13682 527 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 EPHA1P21709 976 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CA6P23280 308 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CAPZA1P52907 286 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 DHRS2Q13268 280 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 EDDM3AQ14507 147 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 LIME1Q9H400 295 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 LHX6Q9UPM6 363 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF175Q9Y473 711 aa4.86□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF732B4DXR9 585 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 AQP7O14520 342 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SOX15O60248 233 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CPT2P23786 658 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 APLNRP35414 380 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ARR3P36575 388 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 FUT6P51993 359 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 RAB14P61106 215 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 IL13RA1P78552 427 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PPP1R1AQ13522 171 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 GABRA6Q16445 453 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 EXTL1Q92935 676 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SLAMF9Q96A28 289 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 TM2D1Q9BX74 207 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 METTL9Q9H1A3 318 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 RGCCQ9H4X1 137 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 MSL2Q9HCI7 577 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SLC7A11Q9UPY5 501 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PRAF2O60831 178 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 TNFSF13O75888 250 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 IL5P05113 134 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 BCL3P20749 454 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PTGER4P35408 488 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 GUSBP1Q15486 140 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 RTL6Q6ICC9 239 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 Q6ZS92 163 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 SARAFQ96BY9 339 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 HYLS1Q96M11 299 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 PRRX2Q99811 253 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 AK3Q9UIJ7 227 aa4.85□□□□□ -1.63
USP15-201ENST00000280377 NUP50Q9UKX7 468 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms