RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.67□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.67□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.67□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.67□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.67□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.67□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 OR4K15Q8NH41 348 aa8.67□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 L7N2F9 121 aa8.66□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 ECH1Q13011 328 aa8.66□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 CLN3Q13286 438 aa8.66□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 GPR35Q9HC97 309 aa8.66□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.66□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.66□□□□□ -1.02
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USP11-201ENST00000218348 C10orf128Q5T292 105 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 FAM27BQ5VT28 67 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 MOB3CQ70IA8 216 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 UPB1Q9UBR1 384 aa8.65□□□□□ -1.02
USP11-201ENST00000218348 C5orf49A4QMS7 147 aa8.65□□□□□ -1.03
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USP11-201ENST00000218348 UBE2CO00762 179 aa8.65□□□□□ -1.03
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USP11-201ENST00000218348 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.64□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 A6NNC1 897 aa8.64□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP11-201ENST00000218348 CD34P28906 385 aa8.64□□□□□ -1.03
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