RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 TMEM17Q86X19 198 aa15.6■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.6■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.6■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 I3L521 148 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 ZNF205O95201 554 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 PXT1Q8NFP0 134 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 GSX2Q9BZM3 304 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 OR51B6Q9H340 312 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 RELNP78509 3460 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 SFT2D2O95562 160 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 COX5BP10606 129 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 SERPINF1P36955 418 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 PRDX4Q13162 271 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 PPA1Q15181 289 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 RTL6Q6ICC9 239 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 COMMD9Q9P000 198 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 HSF4Q9ULV5 492 aa15.59■□□□□ 0.09
USP18-201ENST00000215794 C5orf51A6NDU8 294 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ADAP1O75689 374 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 TSPAN9O75954 239 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 FCGR3AP08637 254 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MPGP29372 298 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 LIME1Q9H400 295 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 IL36GQ9NZH8 169 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SPTA1P02549 2419 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 KCNAB3O43448 404 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ARR3P36575 388 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 GPM6AP51674 278 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 FGL1Q08830 312 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 BEX5Q5H9J7 111 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 COMMD7Q86VX2 200 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 TECTBQ96PL2 329 aa15.58■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MPTX1A8MV57 137 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 KNG1P01042 644 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 WNT5AP41221 380 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MALLQ13021 153 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 Q6ZPA2 131 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SLAMF9Q96A28 289 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 WBP1Q96G27 269 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.57■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 KALRNO60229 2985 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 POM121CA8CG34 1229 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 F8VVB4 439 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 F8VWA3 439 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 LILRA1O75019 489 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SPDEFO95238 335 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 PGAM2P15259 253 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 AANATQ16613 207 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MED12LQ86YW9 2145 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 RNF222A6NCQ9 220 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SLC25A4P12235 298 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 BCL3P20749 454 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 HAAOP46952 286 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 PLP2Q04941 152 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 TMEM65Q6PI78 240 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MDP1Q86V88 176 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 FAM219AQ8IW50 185 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 COQ8AQ8NI60 647 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.56■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 B3GALNT1O75752 331 aa15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 RRASP10301 218 aa15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 PTGER4P35408 488 aa15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP18-201ENST00000215794 CCDC120Q96HB5 630 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 2278.1 ms