RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRR20A	P86496	221 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR52W1	Q6IF63	320 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RRM2B	Q7LG56	351 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR8H2	Q8N162	312 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TOMM40L	Q969M1	308 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ITFG2	Q969R8	447 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPE	Q96AT9	228 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TPD52L3	Q96J77	140 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ABCG5	Q9H222	651 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	KLK15	Q9H2R5	256 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR51J1	Q9H342	316 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RGCC	Q9H4X1	137 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC01619	G3V211	115 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	FFAR1	O14842	300 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV1D-33	P01593	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGKV1-33	P01594	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CDK2	P24941	298 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC15A1	P46059	708 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM65	Q6PI78	240 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PGAM5	Q96HS1	289 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCTD7	Q96MP8	289 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CGREF1	Q99674	301 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	STUB1	Q9UNE7	303 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A1W2PPI3	338 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM82	A0PJX8	343 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR5B21	A6NL26	309 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFNA14	P01570	189 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	GDNF	P39905	211 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	GZMM	P51124	257 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRRX1	P54821	245 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZP1	P60852	638 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRT71	Q3SY84	523 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	AGK	Q53H12	422 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	FGD3	Q5JSP0	725 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZBTB9	Q96C00	473 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	HES4	Q9HCC6	221 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	THAP1	Q9NVV9	213 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A087WW49	117 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	DHRS12	A0PJE2	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	UNC119B	A6NIH7	251 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337		J3QT63	122 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNIH1	O95406	144 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	APOC1	P02654	83 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD34	P28906	385 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	HAAO	P46952	286 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	GRK1	Q15835	563 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	UTF1	Q5T230	341 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	MOB3C	Q70IA8	216 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	FANK1	Q8TC84	345 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SPTAN1-231	ENST00000636337	IFT27	Q9BW83	186 aa		7.47	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms