RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EDDM3BP56851 147 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM189A2Q15884 450 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SSX2Q16385 188 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ODF4Q2M2E3 257 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q6ZS46 218 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DTX3Q8N9I9 347 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TBX5Q99593 518 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MMP28Q9H239 520 aa8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM82A0PJX8 343 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 H3BSH0 61 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 INMTO95050 263 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DYNLT3P51808 116 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR8H2Q8N162 312 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLAMF9Q96A28 289 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CEP19Q96LK0 163 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRT84Q9NSB2 600 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.92□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SYT7O43581 403 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHA1P01876 353 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRT8P05787 483 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BLCAPP62952 87 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GID4Q8IVV7 300 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SNX22Q96L94 193 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF714Q96N38 554 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR5M11Q96RB7 305 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHST5Q9GZS9 411 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.91□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 hADV38S2A0JD32 116 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 METTL15A6NJ78 407 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 G3V2T6 193 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 XPNPEP2O43895 674 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PSPNO60542 156 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MMP23AO75900 390 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 APOL3O95236 402 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HAND1O96004 215 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NPBWR2P48146 333 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FUT6P51993 359 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACTA2P62736 377 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACTG2P63267 376 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACTC1P68032 377 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACTA1P68133 377 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF91Q05481 1191 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EDDM3AQ14507 147 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATP6AP1Q15904 470 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 REC114Q7Z4M0 266 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 R3HDM4Q96D70 268 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BORCS8Q96FH0 119 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHST6Q9GZX3 395 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.9□□□□□ -0.98
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms