RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SSX4O60224 188 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RFX2P48378 723 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVK11-1P61568 191 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GDPD3Q7L5L3 318 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TOMM5Q8N4H5 51 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PLK3Q9H4B4 646 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CHD6Q8TD26 2715 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1B0GVG6 124 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LPLP06858 475 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PGA5P0DJD9 388 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MPPED2Q15777 294 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ELMOD3Q96FG2 381 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PECRQ9BY49 303 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RHOFQ9HBH0 211 aa22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PLAUP00749 431 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MZT1Q08AG7 82 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM16LQ309B1 348 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ST8SIA4Q92187 359 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 IL36RNQ9UBH0 155 aa22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LYRM1O43325 122 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF81P51508 661 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 Q6ZNX1 250 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MEIS3P1A6NDR6 274 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 C3orf80F5H4A9 247 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SSX5O60225 188 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RBBP9O75884 186 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CHATP28329 748 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 HSF4Q9ULV5 492 aa22.04■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A10PA6NDY2 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A18PA6NE21 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A16PA6NEW6 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A7PA6NKC0 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A22PA8MWA6 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A12PA8MX19 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRY3O43610 288 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A15PP0C7V4 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A13PP0C7W8 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A14PP0C7W9 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM90A24PP0C7X0 464 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SPNP16150 400 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRNQ5BIV9 151 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR82Q6UXN9 313 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 Q8IYB0 196 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM58AQ8N1B3 248 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2V2Q96R30 315 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CACNG2Q9Y698 323 aa22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 IGHV1-46P01743 117 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKACAP17612 351 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SERPINF1P36955 418 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 DYRK1AQ13627 763 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 POC1AQ8NBT0 407 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAMP4-210ENST00000588555 VSTM5A8MXK1 200 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PRSS44E7EML9 344 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 C19orf84I3L1E1 186 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 ARL6IP1Q15041 203 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PDCD1Q15116 288 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3IP1Q96FE7 263 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.02■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 SERPINE3A8MV23 424 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 ADH4P08319 380 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 IGFBP2P18065 325 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 KIR2DL3P43628 341 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 SNU13P55769 128 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SCAMP4-210ENST00000588555 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.01■■□□□ 1.11
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