RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	DUX4	Q9UBX2	424 aa		20.78	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB3	O43676	98 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	GPX5	O75715	221 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	CAPZA1	P52907	286 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	ZP1	P60852	638 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	GAFA1	Q96PS6	74 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	HES4	Q9HCC6	221 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	ING4	Q9UNL4	249 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		20.77	■□□□□ 0.92
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DVL1	O14640	695 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1D-12	P01611	117 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SELL	P14151	372 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ERVK11-1	P61568	191 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	IL13RA1	P78552	427 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	RSU1	Q15404	277 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		20.76	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SC5D	O75845	299 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ARL6IP5	O75915	188 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	KNG1	P01042	644 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	UCHL1	P09936	223 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CPT2	P23786	658 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	NPY4R	P50391	375 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MED30	Q96HR3	178 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		20.75	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229		A8MXK9	166 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	INAFM1	C9JVW0	142 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	KDM4B	O94953	1096 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CDRT1	O95170	752 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB7	P17568	137 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SRM	P19623	302 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	PRDX2	P32119	198 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	FGFRL1	Q8N441	504 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MUL1	Q969V5	352 aa		20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JMP0	313 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0X1KG70	313 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	HTR3B	O95264	441 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SFTPB	P07988	381 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	AMY2B	P19961	511 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP1	P28562	367 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	PTGFR	P43088	359 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	AWAT2	Q6E213	333 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CD177	Q8N6Q3	437 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	PHYHIP	Q92561	330 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	METTL9	Q9H1A3	318 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	GLS2	Q9UI32	602 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF222	Q9UK12	451 aa		20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	20.73	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	MEGF11	A6BM72	1044 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SIGLEC5	O15389	551 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SERPINA2	P20848	420 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	DGUOK	Q16854	277 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	CR1L	Q2VPA4	569 aa		20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
GPS1-223	ENST00000584229	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		20.72	■□□□□ 0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms