RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 BATF2Q8N1L9 274 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AQP3Q92482 292 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RORBQ92753 470 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 Q96MT0 163 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TBX15Q96SF7 602 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MBOAT4Q96T53 435 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP21Q9H596 190 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RASL12Q9NYN1 266 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AASSQ9UDR5 926 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 E9PQ18 207 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 J3QL48 77 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 J3QLW9 94 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 J3QT63 122 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC1A7O00341 560 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SYNGR1O43759 233 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MPZL2O60487 215 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 INMTO95050 263 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NXPH2O95156 264 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CRYBA1P05813 215 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PSG2P11465 335 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MMP9P14780 707 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF19P17023 458 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AMY2BP19961 511 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IFITM2Q01629 132 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF85Q03923 595 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FOXL1Q12952 345 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OCLNQ16625 522 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LCE2CQ5TA81 110 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KRT74Q7RTS7 529 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RDH10Q8IZV5 341 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF488Q96MN9 340 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GAFA1Q96PS6 74 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MMP27Q9H306 513 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 KPTNQ9Y664 436 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRD5 423 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRF3 423 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRM7 423 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FAM172BPA6NC97 362 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC5O15389 551 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FCN3O75636 299 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 UPK1BO75841 260 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PTTG1O95997 202 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-69P01742 117 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF20P17024 532 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CCL1P22362 96 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CFPP27918 469 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PRDX2P32119 198 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FUT6P51993 359 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR12D2P58182 307 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF45Q02386 682 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CD300CQ08708 224 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 AWAT1Q58HT5 328 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM42Q69YG0 159 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SVOPQ8N4V2 548 aa6.86□□□□□ -1.31
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