RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 BRD7Q9NPI1 651 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 VSIG4Q9Y279 399 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 UNC119BA6NIH7 251 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 CD34P28906 385 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 PRRX1P54821 245 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 SLURP1P55000 103 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 PITPNAQ00169 270 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 TOMM40LQ969M1 308 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 ABCG5Q9H222 651 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 OR51J1Q9H342 316 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-212ENST00000582376 DHRS12A0PJE2 317 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 LINC01619G3V211 115 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 J3QT63 122 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1D-33P01593 117 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1-33P01594 117 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 CDK2P24941 298 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 SLC6A6P31641 620 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 HAAOP46952 286 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 OMPP47874 163 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 TMEM65Q6PI78 240 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 MOB3CQ70IA8 216 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FANK1Q8TC84 345 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 SNX22Q96L94 193 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 HES4Q9HCC6 221 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 STUB1Q9UNE7 303 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 TMEM82A0PJX8 343 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ANGPT2O15123 496 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 IGLV1-51P01701 117 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 OR5H8P0DN80 308 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 PEX2P28328 305 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ZP1P60852 638 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 SELENOWP63302 87 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 GRK1Q15835 563 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 TEX30Q5JUR7 227 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 EPGNQ6UW88 154 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KRT74Q7RTS7 529 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ZNF573Q86YE8 665 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 OR2T4Q8NH00 348 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KCTD7Q96MP8 289 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 IFT27Q9BW83 186 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KLK15Q9H2R5 256 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 OR52D1Q9H346 318 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 NIPAL2Q9H841 368 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 CD300AQ9UGN4 299 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 A0A1B0GVY2 172 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 A0A1W2PPI3 338 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FAM183AA6NL82 134 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 IDH3BO43837 385 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 FMO3P31513 532 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-212ENST00000582376 KDELR2P33947 212 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms