RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	THRSP	Q92748	146 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1W2PPH5	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	FCN3	O75636	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	BMX	P51813	675 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CAPZA1	P52907	286 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	BLMH	Q13867	455 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	STAB1	Q9NY15	2570 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1B0GW55	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PLAT	P00750	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SOX2	P48431	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	POU3F4	P49335	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ARF6	P62330	175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PPP3R1	P63098	170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	KISS1	Q15726	138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		Q499Y3	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ATR	Q13535	2644 aa		13.56	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		K7N7A8	449 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		M0R1W7	72 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SH2D1B	O14796	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	GPX5	O75715	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	LALBA	P00709	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TK1	P04183	234 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MMP9	P14780	707 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	CEL	P19835	753 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SLC35A2	P78381	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	GPR50	Q13585	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF146	Q15072	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SNX22	Q96L94	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		Q9H521	79 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1W2PPE2	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1W2PQ09	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1W2PR64	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357		A0A1W2PRV1	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	KDM4B	O94953	1096 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	INMT	O95050	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SELL	P14151	372 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	HILS1	P60008	231 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SPHAR	Q15513	63 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	GPER1	Q99527	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	RGS10	O43665	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT20-210	ENST00000580357	TFF1	P04155	84 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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