RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 PGA5P0DJD9 388 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 DCKP27707 260 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 STX19Q8N4C7 294 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N7P7 452 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.86□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 FBP1P09467 338 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 OMGP23515 440 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 MPZP25189 248 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TMBIM6P55061 237 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF85Q03923 595 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ST3GAL4Q11206 333 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 IRF3Q14653 427 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TP53I3Q53FA7 332 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RNLSQ5VYX0 342 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 AMBNQ9NP70 447 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 GNG8Q9UK08 70 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 SLC7A11Q9UPY5 501 aa11.85□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GUS0 222 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 H3BSH0 61 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 NPFFO15130 113 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 INMTO95050 263 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 IGHV4-59P01825 116 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PRDX2P32119 198 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RAG2P55895 527 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ACTC1P68032 377 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ACTA1P68133 377 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 KLRD1Q13241 179 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 KLHL22Q53GT1 634 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF561Q8N587 486 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 CD177Q8N6Q3 437 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 OR4F5Q8NH21 305 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF14Q92956 283 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 RNFT2Q96EX2 444 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PKIBQ9C010 78 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 MMP24Q9Y5R2 645 aa11.84□□□□□ -0.51
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PRD5 423 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PRF3 423 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PRM7 423 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 BTBD17A6NE02 478 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 GPR137BO60478 399 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFA7O95182 113 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 PAHP00439 452 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 SERPINA3P01011 423 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 KIR3DL2P43630 455 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 MAP2K4P45985 399 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 IER3P46695 156 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 DLX1P56177 255 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF91Q05481 1191 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 IL24Q13007 206 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 GPR107Q5VW38 600 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 ANGPTL5Q86XS5 388 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 CALHM1Q8IU99 346 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 DYRK2Q92630 601 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 ISOC1Q96CN7 298 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf35Q96D05 121 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM80Q96HE8 168 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 CHST5Q9GZS9 411 aa11.83□□□□□ -0.52
CMTM3-215ENST00000568477 SLITRK2Q9H156 845 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms