RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SPRNQ5BIV9 151 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OTPQ5XKR4 325 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 MCFD2Q8NI22 146 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SPTSSAQ969W0 71 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PHF21AQ96BD5 680 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf35Q96D05 121 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 WDFY2Q96P53 400 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR14A2Q96R54 314 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 HHLA2Q9UM44 414 aa7.7□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC30A6NM36 301 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM178BH3BS89 294 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 J3QW42 95 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PDCD5O14737 125 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ICMTO60725 284 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF205O95201 554 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ACSM4P0C7M7 580 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OCM2P0CE71 109 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SRMP19623 302 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IER3P46695 156 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TPTEP56180 551 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 INSL4Q14641 139 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TAF13Q15543 124 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF774Q6NX45 483 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 S100ZQ8WXG8 99 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM106AQ96A25 262 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 RGCCQ9H4X1 137 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM165Q9HC07 324 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IL19Q9UHD0 177 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.69□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GTI1 187 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 NOTOA8MTQ0 251 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 M0R135 149 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 DOK2O60496 412 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN9O75954 239 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 RAB3BP20337 219 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CFHR2P36980 270 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 WNT5AP41221 380 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CX3CR1P49238 355 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SCAND1P57086 179 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CEP78Q5JTW2 689 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CD276Q5ZPR3 534 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF529Q6P280 563 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 KRT74Q7RTS7 529 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 SPERTQ8NA61 448 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 LHX4Q969G2 390 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF799Q96GE5 643 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CMTM3Q96MX0 182 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 TECTBQ96PL2 329 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 OR2V2Q96R30 315 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PALMDQ9NP74 551 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 DHDHQ9UQ10 334 aa7.68□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0U1RQK1 487 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 MEGF11A6BM72 1044 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 AIPO00170 330 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV1-69P01742 117 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 LIPFP07098 398 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 IRF2P14316 349 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 S100A5P33763 92 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 RANBP1P43487 201 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 BMXP51813 675 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 PRKXP51817 358 aa7.67□□□□□ -1.18
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF45Q02386 682 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms