RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZTK2	550 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PKIB	Q9C010	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	BANF2	Q9H503	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067		A6NLC8	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ORC5	O43913	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NXPH2	O95156	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CLDN14	O95500	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF250	P15622	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GNLY	P22749	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MPV17	P39210	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TAS2R19	P59542	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZP1	P60852	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	QRFP	P83859	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DGCR2	P98153	550 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TLE1	Q04724	770 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	UNC119	Q13432	240 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms