RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 OLIG2Q13516 323 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PLGLAQ15195 96 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF429Q86V71 674 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR2M7Q8NG81 312 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF1AP19438 455 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 SERPINA11Q86U17 422 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 F5H5K5 113 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CDC14BO60729 498 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF6BO95407 300 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EMC4Q5J8M3 183 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SYT9Q86SS6 491 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RCE1Q9Y256 329 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 RUNX2Q13950 521 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 D2HGDHQ8N465 521 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 ARSGQ96EG1 525 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf36Q96KX1 117 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CALHM2Q9HA72 323 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RAB27BO00194 218 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 PMELP40967 661 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 EID2BQ96D98 161 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR4C46A6NHA9 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SOD3P08294 240 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MEOX1P50221 254 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LEG1Q6P5S2 330 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CA13Q8N1Q1 262 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF611Q8N823 705 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.61□□□□□ -1.51
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