RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK1	P06870	262 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2H1	P32780	548 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF138	P52744	262 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PSG7	Q13046	419 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF79	Q15937	498 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	NPW	Q8N729	165 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF596	Q8TC21	504 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	APH1B	Q8WW43	257 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf60	Q96EN9	201 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RDH14	Q9HBH5	336 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF225	Q9UK10	706 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP9	Q99996	3911 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRP	O00591	440 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	GMDS	O60547	372 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC19A2	O60779	497 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	MPDU1	O75352	247 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB3D	O95716	219 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV1-47	P01700	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DRA	P01903	254 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOC	P08134	193 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PAEP	P09466	180 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	THRA	P10827	490 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CDKN2B	P42772	138 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5J2	P56134	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ADIG	Q0VDE8	80 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	SLA	Q13239	276 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RCAN2	Q14206	197 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PRPSAP1	Q14558	356 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	STK38	Q15208	465 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	STK11	Q15831	433 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	POU2AF1	Q16633	256 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf183	Q5T699	404 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	H2AFV	Q71UI9	128 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB43	Q86YS6	212 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8K3	Q8NH51	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4S2	Q8NH73	311 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	BAALC	Q8WXS3	180 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM230	Q96A57	120 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF185	Q96GF1	192 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	LHX9	Q9NQ69	397 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNK	Q9P0W0	207 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA4	P78363	2273 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNA1C	Q13936	2221 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NDN8	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ARGFX	A6NJG6	315 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		H7C1H1	209 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PANO1	I0J062	215 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		K7EM74	188 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308		M0QX08	132 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD51B	O15315	384 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CD5L	O43866	347 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF861P	O60384	105 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CTSL	P07711	333 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF17	P17021	662 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	F2R	P25116	425 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	CEACAM3	P40198	252 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	NMU	P48645	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB7A	P51149	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	FABP6	P51161	128 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGG	Q5H8A4	983 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNHG1-222	ENST00000545308	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97

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