RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531842.1

USF1-210, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene USF1, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-210ENST00000531842 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 AMIGO2Q86SJ2 522 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 CPOQ8IVL8 374 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.13□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.13□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 UTF1Q5T230 341 aa7.12□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ZNF626Q68DY1 528 aa7.12□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.12□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 MALSU1Q96EH3 234 aa7.12□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.12□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 ACTR3P61158 418 aa7.11□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 ACTC1P68032 377 aa7.11□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 DGCR2P98153 550 aa7.11□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.11□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ZAR1LA6NP61 321 aa7.1□□□□□ -1.27
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