RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACTBL2Q562R1 376 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPRNQ5BIV9 151 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPATA21Q7Z572 469 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC35E3Q7Z769 313 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UNC93AQ86WB7 457 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CA13Q8N1Q1 262 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VPS37AQ8NEZ2 397 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RLN3Q8WXF3 142 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC7A6Q92536 515 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CDS1Q92903 461 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TPD52L3Q96J77 140 aa-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 SYNCQ9H7C4 482 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC39A9Q9NUM3 307 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MED29Q9NX70 200 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DCAF16Q9NXF7 216 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTFP1Q9UDX5 166 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LAMP5Q9UJQ1 280 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMCO1Q9UM00 188 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RASD1Q9Y272 281 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ABCB11O95342 1321 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTPRJQ12913 1337 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A087WTM6 91 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARGFXA6NJG6 315 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM212A6NML5 194 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 M0R3E3 92 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 KERAO60938 352 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GFPT2O94808 682 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SOX14O95416 240 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LY6G6CO95867 125 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SERPINA3P01011 423 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF728P0DKX0 622 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 HTR1DP28221 377 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HTR2AP28223 471 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANAPC15P60006 121 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ROMO1P60602 79 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR5I1Q13606 314 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COG2Q14746 738 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 EPSTI1Q96J88 318 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADPGKQ9BRR6 497 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZWILCHQ9H900 591 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACER3Q9NUN7 267 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 FLVCR2Q9UPI3 526 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TTLL3Q9Y4R7 772 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NPTNQ9Y639 398 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USF3Q68DE3 2245 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa-1.66□□□□□ -2.68
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