RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLHL14Q9P2G3 628 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR14J1Q9UGF5 321 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNE5Q9UJ90 142 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CELA1Q9UNI1 258 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SELENOKQ9Y6D0 94 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV25A0A0B4J276 109 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A10PA6NDY2 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A18PA6NE21 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A16PA6NEW6 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C46A6NHA9 309 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf70A6NJV1 201 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM210A6NLX4 147 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A12PA8MX19 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 F5H5K5 113 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0YJW9 148 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCR6O00574 342 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC22O60826 627 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM24O75264 130 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRMUO75648 421 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOSP00540 346 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT-ATP6P00846 226 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV2-11P01706 119 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 REG1AP05451 166 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYGBP07316 175 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A15PP0C7V4 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A13PP0C7W8 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A14PP0C7W9 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM90A24PP0C7X0 464 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXA5P20719 270 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK2P24941 298 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFYBP25208 207 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUSP1P28562 367 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDX2P32119 198 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDOSTP39656 456 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MECP2P51608 486 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EMP1P54849 157 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLX6P56179 175 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MXRA7P84157 204 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMODQ06828 376 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BNIP1Q12981 228 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED21Q13503 144 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASAH1Q13510 395 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AQP6Q13520 282 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLGLAQ15195 96 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMDQ15546 238 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM83EQ2M2I3 478 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LIN52Q52LA3 116 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM41BQ5BJD5 291 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM91A1Q658Y4 838 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AADACL2Q6P093 401 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OLIG3Q7RTU3 272 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAVSQ7Z434 540 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC91Q7Z6B0 441 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPRA1Q86W33 373 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 YIPF7Q8N8F6 280 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR56B2PQ8NGI1 322 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR9G1Q8NH87 305 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1L1Q8NH94 360 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMA8Q8TAA3 256 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM76AQ8TAV0 307 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SFXN5Q8TD22 340 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC41A3Q96GZ6 507 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKNOX2Q96KN3 472 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOVQ96L33 236 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RDH12Q96NR8 316 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52E6Q96RD3 313 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB40CQ96S21 281 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBOAT4Q96T53 435 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCHR1Q99705 422 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUT8Q9BYC5 575 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHST5Q9GZS9 411 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDHD2Q9H0R4 259 aa1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms