RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	OR2C3	Q8N628	320 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM104	Q8NE00	496 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A7	Q92504	469 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TRIB1	Q96RU8	372 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ANK1	P16157	1881 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LMX1B	O60663	402 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TNFSF15	O95150	251 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CA6	P23280	308 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GNG3	P63215	75 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DHODH	Q02127	395 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FHL5	Q5TD97	284 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ERGIC1	Q969X5	290 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KLK13	Q9UKR3	277 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPQ1	181 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CCL3	P10147	92 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HNF1A	P20823	631 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPR12	P47775	334 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZXDA	P98168	799 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRDX4	Q13162	271 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CARF	Q8N187	725 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		7.11	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A20	A6NK97	555 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	S100A8	P05109	93 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ARL3	P36405	182 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RAC3	P60763	192 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GAB4	Q2WGN9	574 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRG7	Q96K78	797 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0B4J293	547 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AQP7P3	A6NL99	342 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SOX15	O60248	233 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ARG1	P05089	322 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR1C1	Q15619	314 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPR37	O15354	613 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KLF4	O43474	513 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RECK	O95980	971 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CD1A	P06126	327 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	WNT16	Q9UBV4	365 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		7.1	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AQP7	O14520	342 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SRD5A2	P31213	254 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2G2	P60604	165 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMUG1	Q53HV7	270 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF429	Q86V71	674 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DYRK2	Q92630	601 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN23	Q96B33	292 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PGA3	P0DJD8	388 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	COX5A	P20674	150 aa		7.09	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	H2BFS	P57053	126 aa		7.09	□□□□□ -1.27

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