RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.51□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 VPS13CQ709C8 3753 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A096LNT2 108 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 H7C1C5 153 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ABCD4O14678 606 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLOCKO15516 846 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MGRN1O60291 552 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCTN3O75935 186 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC2A10O95528 541 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHMP01871 453 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFNW1P05000 195 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC159P0C7I6 412 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CECR9P0C854 216 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 THRBP10828 461 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSKH1P11801 424 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 B4GALT1P15291 398 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF43P17038 809 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR4P46093 362 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CAPZA2P47755 286 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MNAT1P51948 309 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TAS2R41P59536 307 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 LCN6P62502 163 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 PMS2P3Q13401 168 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CAMK2DQ13557 499 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GSG1Q2KHT4 349 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 C10orf128Q5T292 105 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 OTPQ5XKR4 325 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 LCN8Q6JVE9 175 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 SKA3Q8IX90 412 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR6X1Q8NH79 312 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM162AQ96A26 154 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 SGTBQ96EQ0 304 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRAPPC10-211ENST00000485621 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRLF2Q9HC73 371 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NANSQ9NR45 359 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GLTPQ9NZD2 209 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ADA2Q9NZK5 511 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MED31Q9Y3C7 131 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1W2PRQ8 180 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CIB4A0PJX0 185 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 SH3PXD2BA1X283 911 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R1B8 84 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCTN6O00399 190 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CASKO14936 926 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRAF2O60831 178 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 HLA-HP01893 362 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF35P13682 527 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTLA4P16410 223 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 CALB2P22676 271 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 AHCYP23526 432 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 RRM2P31350 389 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 GSSP48637 474 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 MEOX2P50222 304 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERVS71-1P61550 626 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERVK-25P63136 954 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 ST3GAL3Q11203 375 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 BNIP1Q12981 228 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 DGCR6Q14129 220 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAM2Q15035 370 aa3.49□□□□□ -1.85
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